Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MTA3Q9BTC8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms