Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COPS4Q9BT78 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS4Q9BT78 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms