Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCM2Q9BSQ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms