Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM29Q9BSF4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms