Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms