Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS2

SYT15, Synaptotagmin-15, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT15Q9BQS2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT15Q9BQS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT15Q9BQS2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT15Q9BQS2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT15Q9BQS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT15Q9BQS2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT15Q9BQS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms