Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MEIS3Q99687 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS3Q99687 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS3Q99687 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms