Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP1Q99575 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POP1Q99575 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP1Q99575 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP1Q99575 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP1Q99575 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP1Q99575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms