Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTCH4Q99466 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOTCH4Q99466 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTCH4Q99466 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms