Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DCLRE1CQ96SD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCLRE1CQ96SD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms