Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UIMC1Q96RL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UIMC1Q96RL1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UIMC1Q96RL1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms