Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85AQ96PX6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms