Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP3Q96P20 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP3Q96P20 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms