Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF599Q96NL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF599Q96NL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms