Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms