Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGD4Q96M96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms