Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM227BQ96M60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM227BQ96M60 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms