Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN2Q96LZ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms