Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms