Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCHS1Q96JQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCHS1Q96JQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCHS1Q96JQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms