Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRIQ1Q96JM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRIQ1Q96JM4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms