Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG2Q96IQ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms