Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNF8Q96H20 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms