Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23CQ96ET8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms