Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRPL53Q96EL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms