Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC126Q96EE4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC126Q96EE4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms