Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PPCDCQ96CD2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPCDCQ96CD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms