Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms