Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms