Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF25Q93038 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms