Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRIM41Q8WV44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms