Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R17PQ8TDU5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms