Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF398Q8TD17 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms