Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROKR1Q8TCW9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms