Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELBQ8NG08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms