Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM3Q8NE01 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM3Q8NE01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms