Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB91

FANCB, Fanconi anemia group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCBQ8NB91 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FANCBQ8NB91 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms