Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZIC4Q8N9L1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms