Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMER3Q8N944 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms