Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms