Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD3Q8N6K7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD3Q8N6K7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms