Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RYBPQ8N488 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms