Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms