Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED8Q8IZ13 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED8Q8IZ13 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms