Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms