Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOT1Q8IXI2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms