Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL3Q8IVW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms