Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL1Q8IU54 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL1Q8IU54 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms