Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCA5Q86VQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms