Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATG9AQ7Z3C6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.9 ms